航科院的基本使命是为中国民航的运行、发展做出重要而有意义的贡献。我们要全面地承担责任，持续参与到中国民航发展的大事业中，为民航发展提供更多、更有价值的成果。
　　我们致力于在民用航空安全与经济管理领域内开展科学研究和开发创新。我们始终强调大局观念和使命意识，依托于科研水平的不断提高，更好地为民航局履行行业管理职责提供强有力的技术支持。
　　履行职责的同时，我们积极地关注客户期望与行业发展趋势，深入研究行业发展规律，提高科技成果的实用性、前瞻性和经济社会效益，使我们的服务更加符合客户要求。这种优质服务不仅要满足客户不断变化和发展的需要，同时，推动行业又好又快的发展。
　　社会为我们的事业提供舞台，是我们终极价值得以实现的载体。我们始终恪守诚信，遵照执行政府的各项政策和法规，积极参与和谐社会建设，以此来履行我们的社会责任。
　　履行使命有赖于我们对未来目标的执着追求。